Dans le petit village de Hananoki, la nuit est calme. Au pied dun arbre gigantesque nommé le Nanja Monja, un vieil homme recueille un bébé qui semble abandonné. Les années passent. Le vieillard vient de mourir et laisse derrière lui son petit-fils, Taro, à présent livré à lui-même. Le collégien, passionné dastronomie, se voit obligé de faire une croix sur ses études pour pouvoir subsister, malgré les protestations de son entourage, à commencer par son amie denfance Michiko. Mais un jour, alors quil observe les étoiles, Taro a la surprise de voir une jeune fille tomber du Nanja Monja alors quelle était en train de lescalader. Se précipitant sur les lieux, il ne trouve au pied de larbre que les vêtements de la jeune fille, qui semble sêtre volatilisée. Mais plus tard, en rentrant chez lui, il a la surprise de découvrir la demoiselle... qui tient dans la paume de sa main ?! Nommée Sora, la demoiselle a rapetissé de manière inexplicable en chutant du Nanja Monja. Commence alors une entente bienveillante entre les deux enfants, alors-même que les mystères autour du grand arbre et du rétrécissement de Sora saccentuent, et quen plus de ses parents, détranges personnes semblent être à la poursuite de la jeune fille, activement recherchée. Dans un cadre champêtre résolument bienveillant et écolo, débute laventure de Taro, Sora et leurs amis, cherchant à percer le mystère du Nanja Monja, ce qui pourrait bien également révéler leurs origines...