Dans le Japon moderne, des morts mystérieuses se font de plus en plus nombreuses dans la ville de Kanata et son ami Tokiji, en effet la tête des victimes se transforme en tête d'animal et fini par exploser. Des rumeurs commencent à se répandre jusqu'au jour où un incident se produit à l'école de Kanata. Il se trouve alors mêlé à tout ça et obtient la capacité de repousser ses limites. C'est par la suite qu'il rencontrera une magnifique et mystérieuse jeune femme nommée Shiki qui le forcera lui et Tokiji à être encore plus impliqués dans tous ces étranges incidents. Mais que se passe-t-il? Quelle est la mystérieuse organisation derrière tout ça? Une conspiration dordre mondiale commence à se mettre en place...